La Bandera tiene tres cuarteles: en la parte superior del lábaro, una cuarta parte junto al asta, el rojo, que simboliza el esfuerzo que realizaron los creadores del colegio; la dedicación constante de los alumnos al estudio; el amor a la cultura, la ciencia y la investigación, que es la mejor senda para llegar a la cumbre de la superación e inmortalidad.
El blanco, corresponde a la otra cuarta parte superior, que simboliza, el sentimiento blancardino que tiene la niñez y ternura nivia de los jóvenes hacia sus padres, seres queridos y al colegio que los está educando y formando, para que sean ciudadanos forjadores de una Patria libre, culta y soberana.
En la parte inferior, una franja grande azul, color de la bandera de Salinas, cantón al que pertenecemos, y es que estamos bajo el cielo azulino y celestial, donde el Todopoderoso nos mira y nos guía; el pacífico mar, con el mismo color divino, a cada instante besa nuestras playas, con sus olas cariñosas y acariciantes; este color admirable, corresponde a los sueños de los creadores de esta Unidad Educativa, a las aspiraciones sublimes de los niños y jóvenes estudiantes, de encontrar en el presente y en el futuro, un porvenir espléndido y de eternas felicidades .